Sinopsis Rainbow Days: Nijiiro Days mengikuti kehidupan penuh warna dan hubungan romantis empat anak SMA—Natsuki Hashiba, seorang pemimpi dengan delusi cinta; Tomoya Matsunaga, seorang playboy narsis yang memiliki banyak pacar; Keiichi Katakura, seorang sadis keriting yang selalu membawa cambuk; dan Tsuyoshi Naoe, seorang otaku yang memiliki pacar yang bercosplay.
