Sinopsis Classroom☆Crisis/クラスルーム☆クライシス: Di Koloni Mars keempat Tokyo terletak sebuah ruang kelas pikiran paling cerdas Kirishina Corporation yang mempelopori pengembangan kedirgantaraan: A-TEC, yang dipimpin oleh insinyur jenius Kaito Sera, dengan bersemangat mengantisipasi kedatangan anggota terbaru mereka. Namun, segera menjadi jelas bahwa mahasiswa pindahan itu hampir tidak biasa-Nagisa Kiryuu, kepala A-TEC yang baru ditunjuk dan adik lelaki dari CEO perusahaan, dikirim untuk mematikan program. Untuk menjaga ruang kelas tetap hidup, Kaito dan murid-muridnya dengan putus asa bekerja untuk mengembangkan penerus roket mereka yang paling kuat, X-2; Sementara itu, Nagisa menaiki tangga perusahaan untuk mengejar misinya sendiri. Terlepas dari ini, pertempuran terpisah mereka segera mengungkapkan bahwa lebih banyak lagi yang terjadi di Kirishina Corporation daripada memenuhi mata.
Kelas Kelas ☆ Krisis mengikuti Kaito dan Nagisa, serta adik perempuan Kaito, Mizuki dan pilot uji A-TEC Iris Shirasaki, dalam sebuah kisah intrik, perang politik, dan, melawan segala kemungkinan, romansa. Ketika Nagisa dan A-Tec diseret lebih jauh dan lebih jauh ke dalam konspirasi Kirishina Corporation, persahabatan tumbuh dan masa lalu diluncurkan ketika mereka berjuang untuk mencegah krisis kelas mereka.