Sinopsis Jibaku Shounen Hanako-kun/地縛少年花子くん/Toilet-Bound Hanako-kun: Tujuh misteri terkenal yang tampaknya dimiliki setiap sekolah adalah pokok legenda urban Jepang. Salah satu kisah yang paling terkenal ini adalah Hanako-san: hantu seorang gadis muda yang menghantui kamar mandi sekolah.
Kamome Academy memiliki versi legenda Hanako-San sendiri. Rumor mengklaim bahwa jika seseorang berhasil berhasil memanggil Hanako-san, dia akan memberikan Summoner apa pun keinginannya. Terpikat oleh gosip, banyak orang telah mencoba memanggilnya, namun setiap upaya telah gagal. Namun, ketika Nene Yashiro, seorang gadis yang berharap untuk kekayaan romantis, berani memanggil Hanako-san, dia menemukan bahwa “gadis” yang dikabarkan itu sebenarnya adalah laki-laki!
Setelah serangkaian peristiwa malang yang melibatkan keinginan romantis Yashiro, ia dengan enggan terjerat di dunia supranatural, menjadi asisten Hanako-kun. Segera, dia mengetahui tentang tugas Hanako-kun yang kurang diketahui: menjaga keseimbangan rapuh antara manusia dan penampakan.
