Sinopsis Mahou Shoujo Lyrical Nanoha StrikerS/Nanoha Season 3/魔法少女リリカルなのはStrikerS/Magical Girl Lyrical Nanoha StrikerS: Penyihir terkemuka Nanoha Takamachi, Fate Testarossa, dan Hayate Yagami sekarang bekerja sebagai personel militer untuk biro administrasi ruang-waktu di planet Midchilda, setelah menyelesaikan studi mereka di Bumi dalam sepuluh tahun terakhir sejak insiden “Book of Darkness”.
Suatu hari, ketiganya akhirnya membantu Biro menanggapi kebakaran bandara yang parah, tetapi upaya mereka tidak dikenali. Serangkaian peristiwa yang tidak menguntungkan memotivasi Hayate untuk menciptakan unit elit Riot Force 6, yang menangani kasus yang melibatkan keselamatan publik serta benda -benda magis berbahaya yang dikenal sebagai Lost Logia. Di sana ketiganya bekerja bersama dengan rekrutan yang menjanjikan Subaru Nakajima, Teana Lanster, Caro Ru Lushe, dan Erio Mondial, yang mengalami pelatihan sulit untuk memenuhi harapan sambil mengatasi rintangan dan mencapai tujuan pribadi.
Namun, melaksanakan misi mereka terbukti menjadi perjuangan yang konstan. Memerangi musuh yang mengeksploitasi logia yang hilang dan menghadapi kritik dari dalam biro, Riot Force 6 dengan cepat menemukan dirinya meregangkan tipis.
