Sinopsis Shinryaku! Ika Musume/The Invader Comes From the Bottom of the Sea!/侵略!イカ娘/The Squid Girl/Squid Girl: Manusia telah lama mencemari lautan, membuang sampah secara sembarangan, dan mencemari perairan yang menjadi rumah bagi banyak makhluk hidup. Penghuni laut menderita akibat keracunan mereka. Akhirnya, seekor cumi-cumi sudah merasa muak dan bersumpah untuk menghukum tindakan egois manusia.
Memiliki semua kemampuan menakutkan dari cumi-cumi seperti tentakel rambut yang kuat, kemampuan meludahkan tinta, dan bahkan menggunakan bioluminesensi sesuka hati, Ika Musume mengambil inisiatif untuk bangkit dari kedalaman lautan dan membalas dendam pada umat manusia! Dia muncul di Lemon Beach House tertentu, sebuah restoran yang dikelola oleh saudara perempuan Eiko dan Chizuru Aizawa. Menganggap mereka sebagai langkah pertama yang mudah menuju dominasi dunia, dia segera menyatakan perang melawan mereka, hanya untuk mengetahui bahwa dia, secara harfiah, adalah seekor ikan yang keluar dari air! Lebih buruk lagi, dia menghancurkan sebagian dinding rumah pantai dalam upaya untuk memamerkan keunggulannya dan akibatnya terpaksa menjadi pelayan untuk membayar biaya perbaikan. Terdampar untuk sementara waktu setelah merasakan kekalahan telak di tangan kakak beradik Aizawa, Ika Musume terpaksa menunda rencananya untuk menguasai dunia.
Terlepas dari kemunduran ini, Ika Musume segera merasa betah dalam posisinya yang tidak terduga sebagai karyawan terbaru Lemon Beach House. Aneh dan lucu, Shinryaku! Ika Musume mengikuti kehidupan barunya di permukaan saat dia membuat kenangan berharga dan bertemu banyak orang baru. Dengan kenalan barunya, Ika Musume ingin menggemparkan dunia, dengan spageti tinta cumi dalam satu waktu!
