Sinopsis Yu☆Gi☆Oh! 5D’s/Yuu Gi Ou: Duel Monsters 5DS/Yugioh 5 D’s/遊☆戯☆王5D’s（ファイブディーズ）/Yu-Gi-Oh! 5D’s: Yuusei Fudou keluar untuk mendapatkan kembali apa yang dicuri darinya.
Dunia Duel telah berevolusi, dengan mengendarai duel menjadi puncak hiburan bagi penduduk Neo Domino City. Mereka dimainkan di D-Wheels, hibrida antara disk duel dan sepeda motor. Setelah Yuusei yang terampil secara mekanis berhasil membangun roda-D-nya sendiri, mantan temannya Jack Atlas mencurinya bersama kartu terbaik Yuusei, Stardust Dragon; membuang kota satelit mereka yang sudah tua, ia melarikan diri ke Neo Domino City.
Dalam dua tahun sejak itu, Jack telah naik ke puncak dunia duel, sementara Yuusei telah membuat persiapan berkat bantuan teman -temannya. Dengan w-wheel barunya selesai, dia sekarang berangkat ke Neo Domino City, satu-satunya tujuannya untuk menemukan Jack. Tanpa diketahui oleh salah satu dari mereka, ada hal -hal jauh lebih besar yang dipertaruhkan daripada yang dapat mereka bayangkan, dengan dalang menarik senar di belakang layar.
